Антивирусы, использующие метод обнаружения подозрительного поведения программ, не пытаются идентифицировать известные вирусы. Вместо этого они прослеживают поведение всех программ. Если программа пытается записать какие-то данные в исполняемый файл (exe-файл), программа-антивирус может пометить этот файл, предупредить пользователя и спросить, что следует сделать.
В отличие от метода соответствия определению вируса в словаре, метод подозрительного поведения даёт защиту от совершенно новых вирусов и сетевых атак, которых ещё нет ни в одной базе вирусов или атак. Однако программы, построенные на этом методе, могут выдавать также большое количество ошибочных предупреждений, что делает пользователя маловосприимчивым к предупреждениям. Если пользователь нажимает мышью на окно «Принять» («Accept») в каждом случае появления такого предупреждения, антивирусная программа не приносит никакой пользы. В последнее время эта проблема ещё более усугубилась, так как стало появляться всё больше невредоносных программ, модифицирующих другие exe-файлы, несмотря на существующую проблему ошибочных предупреждений.